Cơ cấu tổ chức Tổng công ty Lắp máy Việt Nam gồm có:

• Đứng đầu Tổng công ty là chủ tịch hội đồng thành viên, chịu trách nhiệm chính về vốn của nhà nước tại Tổng công ty.
• Khối cơ quan Tổng công ty: Gồm các Ban chức năng giúp việc cho Tổng giám đốc điều hành các hoạt động sản xuất kinh doanh của Tổng công ty.

Các công ty thành viên:

• Các đơn vị phụ thuộc:
  • Công ty Đầu tư và Phát triển bắc Vinh.
  • Viện công nghệ Hàn.
  • Trạm y tế cơ quan.
• Tổng công ty sở hữu 100% vốn:
  • Công ty TNHH một thành viên LISEMCO
• Công ty cổ phần Tổng công ty giữ cổ phần chi phối:
  • Công ty cổ phần LILAMA 3.
  • Công ty cổ phần LILAMA 5.
  • Công ty cổ phần LILAMA 7.
  • Công ty cổ phần LILAMA 10.
  • Công ty cổ phần LILAMA 18.
  • Công ty cổ phần LILAMA 45-1.
  • Công ty cổ phần LILAMA 45-3.
  • Công ty cổ phần LILAMA 45-4.
  • Công ty cổ phần LILAMA 69-1.
  • Công ty cổ phần LILAMA 69-2.
  • Công ty cổ phần LILAMA 69-3.
  • Công ty cổ phần LILAMA Hà Nội.
  • Công ty cổ phần LILAMA Thí nghiệm cơ điện.
  • Công ty cổ phần Cơ khí lắp máy LILAMA.
  • Công ty cổ phần Thủy điện Sông Ông.
  • Công ty cổ phần Thủy điện Sông Vàng.
  • Công ty cổ phần Đầu tư và Phát triển đô thị LILAMA.UDC.
  • Công ty cổ phần Tư vấn Quốc tế LHT.
  • Công ty cổ phần Tôn mạ màu Việt-Pháp.
• Các công ty liên kết:
  • Công ty POS-LILAMA.
  • Công ty cổ phần thủy điện Hủa NA.
  • Công ty cổ phần xi măng Sông Thao.
  • Công ty cổ phần Đầu tư-Xây dựng LILAMA.
  • Công ty cổ phần Bất động sản LILAMA.
  • Công ty cổ phần Tư vấn thiết kế CIMAS.
  • Công ty cổ phần Chế tạo giàn khoan Dầu khí.
  • Công ty cổ phần Cơ điện môi trường LILAMA.
• Đơn vị sự nghiệp
  • Trường cao đẳng nghề LILAMA - I.